Михаило-Архангельская Церковь в с. Алпаево была основана в 1906г. на средства прихожан. Деревянное здание церкви было построено на каменном фундаменте. Престол в церкви был один – во имя Архистратига Михаила. Штат церкви состоял из священника и псаломщика.
При церкви имелось 795 саженей усадебной земли вместе с погостом и 33 десятины пахотной земли.
в 1907 году при церкви с. Алпаево в собственном здании была открыта земская школа.
На 1 января 1931 года церковь значилась как действующая.
В феврале 1934 года на заседании М.-Боклинского райисполкома было принято решение о закрытии церкви в с. Алпаево (протокол М.-Боклинского райисполкома от 10.02.1934г. № 106 (Ф.227.Д.14.Л.57).